A Paróquia São Francisco das Chagas foi desmembrada da Paróquia de Santa Teresinha aos 03 de maio de 1962, pelo então Arcebispo Metropolitano de São Luis do Maranhão, Dom José de Medeiros Delgado.
Foi coordenada de início por Frei Francisco Pohlmann, que construiu a Igreja Matriz, a qual foi benta aos 31 de dezembro de 1962, por Dom Felipe Conduru Pacheco, Bispo emérito de Parnaíba (PI).
Foi aos 31 de dezembro de 1964, que Frei Eduardo Albers assumiu a coordenação da Paróquia. Como Pároco estruturou a paróquia, criando o Conselho Paroquial, a cruzada eucarística, a Legião de Maria e grupos de casais.
Já em 1966, a partir de encontros de oração no mês de maio, nas casas, que começou a catequese de adultos na cidade pelos legionários.
Foi a partir de janeiro de 1967 que o tributo sagrado começou a fazer parte dos compromissos dos paroquianos da cidade.
Os párocos com a colaboração dos vigários trabalhando na cidade e no interior, através de cursos administrados no Seminário Catequético organizaram as CEB’s (Comunidades Eclesiais de Base) com o culto da Palavra de Deus aos domingos, para as famílias e a catequese de iniciação para crianças e jovens.
Com a criação da Diocese de Bacabal em 1968, a Paróquia de São Francisco, além de parte de Bacabal, Lago Verde, Olho D’água das Cunhas, incluiu também Pio XII. O total de comunidades em 1977 era de 79.

A Paróquia abrange atualmente metade do município de Bacabal e os municípios de Lago Verde e Bom Lugar, com uma população estimada em 58.949 habitantes, sendo 35.536 na Zona Urbana e 23.413 na Zona Rural. É composta por 100 comunidades sendo 13 na zona urbana (centro e periferia) e 87 na zona rural, agrupadas em 19 regionais, com seus conselhos que orientam, organizam e agem.
São Frades, leigos, assistentes paroquiais, dirigentes, catequistas, jovens que caminham rumo a construção do reino de Deus à frente de pastorais e movimentos atuantes.

São Francisco de Assis nasceu na cidade de Assis, Úmbria, Itália, no ano de 1182; de pai comerciante, o jovem rebento de Bernardone, gostava das alegres companhias e gastava com certa prodigalidade o dinheiro do pai. Sonhou com as glórias militares, procurando desta maneira alcançar o "status" que a sua condição exigia, e aos vinte anos, alistou-se como cavaleiro no exército de Gualtieri de Brienne, que combatia pelo papa; mas em Espoleto teve um sonho revelador no qual era convidado a seguir de preferência o Patrão do que o servo e, em 1206 , aos 24 anos de idade para espanto de todos, Francisco de Assis abandonou tudo: riquezas, ambições, orgulho, e até da roupa que usava, para desposar a Senhora Pobreza e repropor ao mundo, em perfeita alegria, o ideal evangélico de humildade, pobreza e castidade, andando errante e maltrapilho, numa verdadeira afronta e protesto contra sua sociedade burguesa.

Já inteiramente mudado de coração, e a ponto de mudar de vida, passou um dia pela igreja de São Damião, abandonada e quase em ruínas. Levado pelo Espírito, entrou para rezar e ajoelhou-se devotamente diante do crucifixo. Tocado por uma sensação insólita, sentiu-se todo transformado. Pouco depois, coisa inaudita, a imagem do Crucificado mexeu os lábios e falou com ele. Chamando-o pelo nome, disse: "Francisco, vai e repara a minha casa que, como vês, está em ruinas".

Com a renúncia definitiva aos bens paternos, aos 25 anos, Francisco deu início à sua vida religiosa. Com alguns amigos deu início ao que seria a Ordem dos Frades Menores ou Franciscanos, cuja ordem foi aprovada pelo Papa Inocêncio III. Santa Clara, sua dilecta amiga, fundou a Ordem das Damas Pobres ou Clarissas. Em 1221, sob a inspiração de seu estilo de vida nasceu a Ordem Terceira para os leigos consagrados. Neste capítulo da vida do santo é caracterizado por intensa pregação e incessantes viagens missionárias, para levar aos homens, frequentemente armados uns contra os outros, a mensagem evangélica de Paz e Bem. Em 1220, voltou a Assis após ter-se aventurado a viagem à Terra Santa, à Síria e ao Egipto, redigindo a segunda Regra, aprovada pelo Papa Honório III. Já debilitado fisicamente pelas duras penitências, entrou na última etapa de sua vida, que assinalou a sua perfeita configuração a